Durchsuchbare Referenzdaten, die für die Nexus-Integration erstellt wurden
Nexus DB ist eine unschätzbare Ressource und in allen Nexus Copy Number-Abonnements enthalten.
Merkmale und Vorteile
Speichern Sie Ihre eigenen Daten
Als Nexus-Benutzer können Sie NexusDB verwenden, um Ihre eigenen Daten privat zu speichern. Die Daten werden mit Hilfe der AWS-Plattform von Amazon extern gesichert.
Referenzdaten
Abfrage nach Genen oder Regionen von Interesse, um Proben und klinische Anmerkungen schnell zu finden, mit der Möglichkeit, Daten zu vergleichen, die von verschiedenen aCGH-, SNP-Array- und NGS-Plattformen generiert wurden.
Referenzdaten in Nexus DB
Die Möglichkeit, Ihre eigenen Daten einfach mit den von Ihnen ausgewählten Personen zu teilen und weltweit zusammenzuarbeiten.
Verfügbare Daten in Nexus DB
Konstitutionelle Genetik
AGRE - Autismus Genetischer Forschungsaustausch. Alle Daten sind sowohl in HG18- als auch in HG19-Genom-Builds verfügbar.
ISCA/ICCG (dbVAR) - Datenbank für strukturelle Variation (SV) von genomischen Varianten mit klinischen Annotationen für ein breites Spektrum von konstitutionellen genetischen Störungen.
Affymetrix CytoScan HD-Referenzprojekt - 375 normale Proben, die zur Erstellung der CytoScan HD-Referenzdatei verwendet wurden
Krebs
TCGA Premier - die TCGA-Daten wurden neu verarbeitet und manuell kuratiert, was zu einer dramatisch gesteigerten Treue und einer entsprechenden Reduzierung der falsch-positiven Anrufe führte.
Zu den Datensätzen gehören akute myeloische Leukämie, Glioblastom (GBM), seröses Ovarialzysten-Adenokarzinom, Nieren-Klarzellenkarzinom, Kolon-Adenokarzinom, Lungen-Plattenepithelkarzinom und mehr.
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