Microarray für DNA BovineSNP50 v3

Übersicht
Das BovineSNP50 v3 BeadChip ist ein Microarray im 24-Proben-Format für hochdichtes Rinder-Genotyping. Es enthält 53.218 informative SNP-Marker, gleichmäßig über das Rindergenom verteilt, zur Unterstützung von genomweiter Selektion, QTL-Identifizierung, Bewertung des genetischen Merits einzelner Tiere und vergleichenden genetischen Studien. Das Array wurde in Zusammenarbeit mit USDA-ARS, University of Missouri und University of Alberta entwickelt und integriert öffentliche Referenzgenomdaten sowie Bovine HapMap. Validiert in 18 gängigen Fleisch- und Milchrinderrassen. Mittlerer Markerabstand: ~37,4 kb.

Hauptmerkmale

• Fester Markerinhalt: 53.218 gleichmäßig verteilte SNPs im Rindergenom
• Erweiterbare Markeranzahl: bis zu 600.000 zusätzliche Marker mit "+" Kit-Versionen
• 24-Proben-BeadChip-Format für mittelgroße Durchsatzmengen
• PCR-freie Einzelröhren-Probenvorbereitung zur Reduzierung von Arbeitsschritten
• Validiert in 18 gängigen Fleisch- und Milchrassen; Inhalt aus Sequenzierung und öffentlichen Ressourcen
• Konzipiert für Kompatibilität mit LIMS und robotischer Automatisierung zur Probenverfolgung und für High-Throughput-Workflows

Technische Details
Assay-Typ: Infinium HTS
Automatisierungsfähigkeit: Automatischer Array-Lader; unterstützt Liquid-Handling-Roboter
Input-Menge: 200 ng DNA (empfohlen, bei 50 ng/µL)
Kompatibles Instrument: iScan System
Methode: Genome-wide Genotyping Array (Infinium)
Nukleinsäuretyp: DNA
Anzahl Marker: 53.218 feste SNP-Marker; erweiterbar bis zu 600.000 Marker (mit "+" Kit-Versionen)
Art: Rind (Milch- und Fleischrassen)
Technologie: Microarray
Mittlerer Markerabstand: ~37,4 kb
Probenformat: 24-Proben BeadChip

Anwendungen / Einsatzfälle

• Genome-wide Association Studies (GWAS) und QTL-Mapping bei Rindern
• Genomische Selektion und Bewertung von Zuchttieren für Milch- und Fleischprogramme
• Populationsgenetik und vergleichende Studien zwischen Rassen
• Kosteneffizientes, hochdurchsatzfähiges Genotyping für Forschung und Zuchtprogramme

Technische Spezifikationen

• Assay-Typ: Infinium HTS
• Automatisierungsfähigkeit: Automatischer Array-Lader; Unterstützung für Liquid-Handling-Roboter
• Input-DNA: 200 ng (empfohlen, bei 50 ng/µL)
• Kompatibles Instrument: iScan System
• Methode: Genome-wide Genotyping Array (Infinium)
• Nukleinsäuretyp: DNA
• Anzahl Marker: 53.218 feste SNPs; erweiterbar bis zu 600.000 (mit "+" Kit-Versionen)
• Art: Rind (Milch- und Fleischrassen)
• Mittlerer Markerabstand: ~37,4 kb
• Probenformat: 24-Proben BeadChip