Software-Modul / für Forschungszwecke SimpleSlideInterface

für Histopathologie-Laborfür virtuelle MikroskopieMakroskopische Bildgebung der Erkrankung

Übersicht
SimpleSlideInterface ist eine REST-ähnliche API und Software-Schnittstelle, die strukturierten programmatischen Zugriff auf digitale Pathologie-Objektträger, Annotationen und Metadaten bietet. Sie integriert 3DHISTECH-Lösungen (SlideCenter, SlideStorageDX) und lokale Repositories mit Drittanbietersystemen, um automatisierte Bildanalyse, KI-Workflows, Hochdurchsatzforschung und klinische Mehrbenutzer‑Zusammenarbeit zu ermöglichen.

Funktionen

• Effizienter Objektträgerzugriff: Abruf, Öffnen und Abfragen von Objektträgern aus lokalem Speicher, SlideCenter und SlideStorageDX.
• Metadatenabruf: Extrahieren von Eigenschaften wie Abmessungen, Auflösung, Kanälen und Scan-Karten.
• Erweiterte Kachel- und Bildverarbeitung: Lesen spezifischer Kacheln oder Regionen basierend auf Koordinaten, Vergrößerung und Fokusindizes.
• Annotationenverwaltung: GeoJSON-basierte Annotationen lesen/einfügen/löschen; Unterstützung für TMA‑Marker.
• Zugriff auf das originale Sichtfeld (FOV): Abruf roher Kameradaten (Lizenz erforderlich).
• Suche und Filterung: Ordner- und Objektträgersuchen über lokale und entfernte Repositories.
• Entwicklerunterstützung: REST-ähnliche API mit Python-Beispielen und Jupyter-Notebook-Integration für schnelles Prototyping.

Wesentliche Merkmale (Übersicht)

• REST-ähnliche API für Zugriff und Manipulation von Objektträgern.
• Python-Beispiele und Jupyter-Notebook-Support.
• Effiziente Kachelabrufe und selektives Lesen von Regionen.
• Sichere Integrationsoptionen für Forschungs- und klinische Bereitstellungen.

Produktvarianten & Lizenzierung

• SimpleSlideInterface (Research Version): forschungsorientierte Edition mit kostenfreiem Zugriff auf Kernfunktionen; eingeschränkter lokaler Durchsatz und lizenzierbare Upgrades für unbegrenzten lokalen Zugriff und schnellere Kachelabrufe.
• SimpleSlideInterface DX (Integration Version): Integrationsedition für klinische/diagnostische Systeme mit lizenziertem Vollzugriff auf SlideStorageDX und sicherem Bildzugriff ohne Abruf von Patientendaten.
• Limitierungen der Gratisversion: einzelne Instanz, eingeschränkter lokaler Zugriff, Kachelabruf begrenzt auf 1000 Kacheln/s (64 MP/s).

Zusätzliche Funktionen

• Pro‑Objektträger Caching von Bild- und Attributdaten beim Öffnen.
• Unterstützung für Lesen/Schreiben von GeoJSON-Annotationen und TMA‑Markerverwaltung.

Systemanforderungen

• Hardware: 4‑Kern‑CPU mit AVX2 (Intel Haswell oder AMD Zen), 4 GB RAM, 1,0 GB freier Festplattenspeicher.
• OS: Windows 10 Pro (64‑bit) oder Windows Server 2019 (64‑bit) mindestens.
• Netzwerk: Mindestbandbreite 1 Gb/s; 10 Gb/s empfohlen für entfernte Objektträger‑Stores.
• Leistung: unterstützt ~8 Objektträger pro CPU‑Thread; ~100 MB RAM pro geöffneter Objektträger.
• Software: Microsoft .NET 8.0 (für Windows Server Hosting); Visual C++ 2015‑2022 Redistributable (x64).

Hinweise
Bei Nutzung mit SlideCenter/SlideStorageDX oder beim Hosting auf einem entfernten Rechner ist hohe Netzwerkbandbreite entscheidend. Die Schnittstelle cached Bild- und Attributdaten beim Öffnen eines Objektträgers, was die Speichernutzung beeinflusst.

Technische Spezifikationen

• Schnittstellentyp: REST-ähnliche API
• Hauptintegrationen: SlideCenter, SlideStorageDX, lokale Objektträger-Repositories
• Entwicklerunterstützung: Python-Beispiele, Jupyter-Notebook-Beispiele
• Annotationsformat: GeoJSON (lesen/einfügen/löschen)
• Kachelabruflimit (kostenlos): 1000 Kacheln/s (64 Megapixel/s)
• Originale Kamera‑FOV‑Abruf: verfügbar (Lizenz erforderlich)
• Speichernutzung pro Objektträger: ~100 MB beim Öffnen
• CPU‑Anforderungen: 4 Kerne mit AVX2; unterstützt 8 Objektträger pro CPU‑Thread
• Mindest‑RAM: 4 GB
• Mindest‑Festplattenspeicher: 1,0 GB frei
• Mindest‑Netzwerkbandbreite: 1 Gb/s (10 Gb/s empfohlen)
• Erforderliche Laufzeit: Microsoft .NET 8.0 (für Windows Server Hosting)