Adapter für Biopharmazeutika KAPA Adapters

F&E

Übersicht
KAPA Adapters sind full‑length und truncated Ligations‑Adapter für die NGS‑Bibliotheksvorbereitung von DNA und RNA, kompatibel mit Illumina‑Sequenzierplattformen. Sie ermöglichen flexible Multiplexing‑Optionen und reduzieren Indexfehlzuweisungen durch Unique Dual‑Index (UDI) Schemata sowie optionale UMIs; Konfigurationen unterstützen bis zu 384‑plex.

Adaptertypen

• Full‑length Adapter: KAPA UDI Adapters — vorgesehen für PCR‑freie Probenvorbereitung; liefern nicht‑redundante Unique Dual‑Index (UDI) Kombinationen, bereitgestellt bei 15 µM.
• Truncated Adapter: KAPA Universal Adapter und KAPA Universal UMI Adapter — bieten erweiterte Indexkapazität und optionale UMIs; geliefert bei 15 µM (Universal) bzw. 33 µM (Universal UMI).
• KAPA UDI Primer Mixes: Vorgeformatierte Primerplatten, die Index‑Sets 1–384 abdecken, für die Verwendung mit Universal‑Adaptern; validiert für UMI‑ und Nicht‑UMI‑Workflows.

Wesentliche Vorteile

• Minderung von Indexfehlzuweisungen: Unique Dual‑Indexing erlaubt das Herausfiltern unerwarteter Barcode‑Kombinationen vor der Analyse und reduziert Index‑Hopping‑Artefakte.
• Sequenzierungsbasierte QC und kontrollierte Fertigung zur Minimierung von Barcode‑Kreuzkontaminationen.
• Konsistente Konversion über Fragmentierungsmethoden (Covaris Shearing und enzymatische Fragmentierung) für robuste Bibliotheksleistung.
• Kompatibel mit PCR‑freien Human‑WGS‑Workflows in Kombination mit KAPA EvoPrep und KAPA EvoPlus V2 Kits.
• Flexibles Multiplexing von niedrigem bis zu 384‑plex, abhängig von Adapter‑ und Primer‑Mix‑Konfiguration.

Empfohlener Einsatz

• Ligationsbasierte NGS‑Bibliotheksaufbauten für DNA und RNA.
• PCR‑freie Bibliotheksvorbereitung mit KAPA UDI Adapters und validierten KAPA‑Kits.
• Hochdurchsatz‑Sequenzierungsprojekte, die Index‑Hopping‑Minderung und zuverlässiges Demultiplexing erfordern.

KAPA‑Adapter Vergleich (Zusammenfassung)
Anzahl UDIs: 96 (KAPA UDI Adapters) / 384 (KAPA Universal Adapter / KAPA Universal UMI Adapter)
Anzahl 8‑nt nicht‑redundanter P5 + P7 Barcodes: 96+96 / 384+384 / 384+384
Barcodes identisch zu Illumina‑Adaptern: Nein / Nein / Nein
Empfohlen für Illumina‑Instrumente (patterned oder non‑patterned Flow Cells): Ja / Ja / Ja
PCR‑freie Bibliotheksvorbereitung (molekular barcoded): Nein / Nein / Nein
Validiert für KAPA EvoPrep Kit, KAPA EvoPlus V2 Kit: Validiert / Kompatibel / Kompatibel
Validiert für KAPA RNA EvoPrep Kit: Validiert / Validiert / Kompatibel
Kompatibel mit KAPA Universal Enhancing Oligos: Ja / Ja / Ja
Adapterformulierung: Full‑length gebrauchsfertig 15 µM (4 Reaktionen/Adapter) / Truncated gebrauchsfertig 15 µM (1 Reaktion/Adapter) / Truncated gebrauchsfertig 33 µM (1 Reaktion/Adapter)
Kit‑Konfiguration: Hard‑shell 96‑Well Platte mit automatisierungsfreundlicher Kennzeichnung, Überfüllungen und Ersatzsiegeln (KAPA UDI Adapters) / Adapter‑Tubes und 96‑Well Primer‑Mix Platten mit automatisierungsfreundlicher Kennzeichnung und Überfüllung (Universal/UMI Varianten)
KAPA Adapter Dilution Buffer enthalten: Ja (25 mL pro KAPA UDI Kit) / Nicht enthalten für truncated Adapter

Leistung und QC‑Hinweise

• Sequenzierungsbasierte In‑House‑QC‑Assays testen Barcode‑Kreuzkontamination, indem jedes UDI an einen einzigartigen synthetischen Insert ligiert, Libraries gepoolt und sequenziert und die Leseverteilung pro Barcode‑Insert‑Kombination ausgewertet wird.
• Nicht‑redundante UDIs reduzieren deutlich die scheinbare Kontamination durch Index‑Hopping im Vergleich zur Einzelindexierung.
• Interne Daten zeigen verringerte Kontaminationsraten und gleichmäßige Konversion/Coverage gegenüber alternativen Bibliotheksvorbereitungsmethoden.

Technische Merkmale / Spezifikationen

• Produktfamilie: KAPA Adapter und Zubehör.
• Adapteroptionen: KAPA UDI Adapters (full‑length, 15 µM), KAPA Universal Adapter (truncated, 15 µM), KAPA Universal UMI Adapter (truncated, 33 µM).
• UDI‑Kombinationen: 96 (KAPA UDI Adapters) oder bis zu 384 (Universal / UMI mit Primer‑Mixes).
• Barcode‑Format: 8‑nt nicht‑redundante P5 + P7 Barcodes.
• Kit‑Konfiguration: Hard‑shell 96‑Well Platten und Adapter‑Tubes mit automatisierungsfreundlicher Kennzeichnung und Überfüllung, wo anwendbar.
• Enthaltene Verbrauchsmaterialien: KAPA Adapter Dilution Buffer (25 mL) enthalten in KAPA UDI Kits; nicht enthalten bei truncated Adaptern.
• Zugelassene Instrumente: Illumina‑Sequenzierinstrumente (patterned und non‑patterned Flow Cells).
• Validierte Anwendungen: DNA‑ und RNA‑NGS‑Bibliotheksvorbereitung; PCR‑freie Human‑WGS bei Verwendung mit KAPA EvoPrep / KAPA EvoPlus V2 Kits; RNA EvoPrep‑Kompatibilität wie angegeben.