NGS-Reagenz KAPA

als Lösungreaktives Milieufür Hybridisierung

Übersicht
Effizientes NGS‑Target‑Enrichment mit den Workflows Roche KAPA HyperCap und KAPA HyperPETE. Lösungen für breite bis fokussierte Panels sowie Unterstützung für kundenspezifische Designs und Proben mit geringer Eingangsmenge wie cfDNA.

Lösung
Umfassendes Portfolio für Target‑Enrichment mit zwei komplementären Technologien. Der KAPA HyperCap‑Workflow ist hybrid‑capture‑basiert und geeignet für größere Panels und umfassende Variantenerkennung. Der KAPA HyperPETE‑Workflow nutzt Primer‑Extension Target Enrichment (PETE) und ist für kleinere, fokussierte Panels sowie ultra‑niedrige Eingaben (z. B. cfDNA) ausgelegt. KAPA HyperPETE verbindet die Schnelligkeit und Einfachheit eines amplicon‑ähnlichen Workflows mit der Performance der Hybrid‑Capture, inklusive guter Uniformität und hoher On‑Target‑Raten.

Integrierte Angebote
Integrierte Workflows mit hochwertigen Sonden/Primern und KAPA Library Prep Kits unterstützen den durchgehenden Prozess von Probe zu Bibliothek für zielgerichtete Sequenzierprojekte.

• Exomsonden: Whole‑Exome‑Lösungen optimiert für breite Datenbankabdeckung
• Catalog panels: vorrätige, fixe Genpanels für schnelle Implementierung
• Design Share panels: fachkundig entworfene Panels in Zusammenarbeit mit Forschern
• Custom probes: maßgeschneiderte Designs für beliebige menschliche oder nicht‑menschliche Genomregionen

Hauptproduktarten und Highlights
Beispielhafte Portfolio‑Elemente und Kurzbeschreibungen:

• KAPA HyperExome V2 Probes and Kits: Whole‑Exome‑Sequencing‑Lösung mit umfassendem Content
• AVENIO Edge System: vollautomatisierter IVD‑Liquid‑Handler für Bibliotheksvorbereitung, Target‑Enrichment, Quantifizierung, Normalisierung und Pooling
• KAPA EvoPlus Boost Kits: DNA‑Bibliotheksvorbereitung mit enzymatischer Fragmentierung und optimiertem, automatisierbarem Workflow
• KAPA HyperCap Catalog Panels and Kits: Genpanels für Target‑Enrichment‑Forschung
• KAPA HyperPETE Catalog Panels and Kits: fixe Panels mit KAPA HyperPETE Hybrid‑Capture‑Technologie
• Design Share Panels: NGS‑Designs von Roche‑Wissenschaftlern und Kooperationspartnern
• HyperDesign: kundenspezifisches Design‑Tool, das KAPA‑Technologie mit Roche‑Sonden/Primer‑Expertise kombiniert
• KAPA HyperCap Custom Probes / KAPA HyperPETE Custom Probes: kundenspezifische Targetsonden/Panels für DNA‑ und RNA‑Regionen

Wert
Target‑Enrichment konzentriert Sequenzierreads auf ausgewählte genomische Regionen und senkt im Vergleich zu Whole‑Genome‑Ansätzen Kosten und Rechenaufwand. Dadurch wird eine höhere Tiefe auf Targets möglich, was die Sensitivität für seltene somatische Varianten in heterogenen oder niedriginput Proben verbessert — entscheidend für Onkologie‑ und translationale Forschung.

Vision
Roche bietet katalogisierte, vorgefertigte und vollständig kundenspezifische NGS‑Target‑Enrichment‑Lösungen, um Sequenzierungsherausforderungen zu meistern und präzise, sensitive Ergebnisse aus schwierigen oder niedriginput Targets zu liefern.

Vergleich / Überlegungen (Zusammenfassung)
Auf der Website befindet sich eine detaillierte Vergleichstabelle zu KAPA HyperCap, KAPA HyperPETE und amplicon‑basierten Workflows hinsichtlich Bedienkomfort, Leistung, Technologie, Durchlaufzeit, Panelgröße, Anwendungen und Analyseunterstützung. Zentrale technische Erkenntnisse sind unten zusammengefasst.

Hinweise
Produkte und Kits sind, sofern angegeben, für Forschungszwecke (RUO) bestimmt.

Technische Spezifikationen

• Workflows: KAPA HyperCap Workflow (Hybridisierungsbasierte Capture); KAPA HyperPETE Workflow (Primer Extension Target Enrichment); Amplicon‑basierte Workflows (PCR‑Amplifikation)
• Benutzerfreundlichkeit: KAPA HyperCap – automatisierbar mit reduziertem Hands‑on‑Aufwand; KAPA HyperPETE – einstufiger Tagesworkflow, automatisierbar; Amplicon – schnellster Workflow
• Leistung: KAPA HyperCap – hohe Sequenzierungseffizienz und Erkennung aller wichtigen Mutationsklassen; KAPA HyperPETE – höchste Effizienz bei kleinen Panels und Erkennung aller Mutationsklassen; Amplicon – gute SNV/Indel‑Performance, geringere Uniformität und eingeschränkte CNV/neu Fusionserkennung
• Durchlaufzeit: KAPA HyperCap – ~1,5 Tage; KAPA HyperPETE – ein Tag; Amplicon – eine Schicht
• Panelgröße: KAPA HyperCap – bis Whole Exome und darüber hinaus; KAPA HyperPETE – bis ~250 Kb; Amplicon – bis einige Megabases (praktische Grenzen)
• Anwendungen: KAPA HyperCap – hereditäre Genetik und hereditäre/somatische Onkologie‑Forschung; KAPA HyperPETE – somatische Onkologie‑Forschung und RNA‑Fusionsnachweis (bekannte + neue Partner); Amplicon – somatische Onkologie‑Forschung und hereditäre Genetik (bekannte Fusionen)
• Sekundäranalyse‑Support: KAPA HyperCap & KAPA HyperPETE – germline und somatic sekundäranalytischer Support mit Open‑Source‑Bioinformatiktools; Amplicon – abhängig vom Anbieter