Steigern Sie Genauigkeit und Durchsatz mit KAPA-Adaptern und Zubehör
Bei der Next-Generation-Sequenzierung (NGS) lässt sich die Effizienz durch die Verwendung indexierter Adapter zur Kennzeichnung von Proben erheblich steigern. Dieser als Multiplexing bezeichnete Prozess ermöglicht es, viele Proben in einem einzigen Sequenzierlauf zu bündeln, wobei die resultierenden Reads anschließend bioinformatisch sortiert werden.
Einige Hochdurchsatz-Sequenzer neigen jedoch zu einer fehlerhaften Zuordnung der Indizes (Index-Hopping), was die Datenqualität beeinträchtigen kann. Strategien mit einzigartiger Doppelindexierung (UDI) tragen dazu bei, die Auswirkungen dieser Ereignisse zu mindern.
Roche bietet zwei Arten von KAPA-Adaptern an:
Adapter in voller Länge: Für die PCR-freie Probenvorbereitung mit bis zu 96 Indexkombinationen
KAPA-UDI-Adapter
Vorteile auf einen Blick
Geringe Fehlzuordnungsraten erhöhen das Vertrauen in die Ergebnisse
Eine falsche Indexzuordnung bei der Multiplex-Sequenzierung kann auf verschiedene Faktoren zurückzuführen sein, darunter:
Index-Hopping
Kreuzkontamination von Barcodes oder Proben
Template-Wechsel während der PCR-Amplifikation gepoolter Proben
Sequenzierungs- oder Analysefehler
Einige dieser Probleme lassen sich durch sorgfältiges Adapterdesign und Qualitätskontrolle mindern.
KAPA-UDI-Adapter sind darauf ausgelegt, zuverlässige Ergebnisse zu gewährleisten durch:
Einzigartige Dual-Index-Kombinationen, die es ermöglichen, Reads mit unerwarteten Barcode-Kombinationen vor der Datenanalyse herauszufiltern
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