Testkit für Pan-Krebs-Analyse AVENIO Surveillance V2

für die medizinische Forschungfür Krebserkrankungenfür Krebserkrankungen

Überblick
Die AVENIO Tumor Tissue Analysis Kits V2 enthalten die Reagenzien zur Isolation von DNA aus formalinfixiertem, in Paraffin eingebettetem Gewebe (FFPE), zur Vorbereitung von Sequenzierungsbibliotheken und zur Anreicherung ausgewählter Regionen mit drei Panel‑Optionen:

• AVENIO Tumor Targeted Panel V2 — 17 Gene
• AVENIO Tumor Expanded Panel V2 — 77 Gene
• AVENIO Tumor Surveillance Panel V2 — 197 Gene

Diese gebrauchsfertigen Kits verwenden einen DNA-only Hybrid-Capture-Workflow zur Profilierung genomischer Veränderungen aus solidem Tumor‑FFPE‑Gewebe. Die Kits ermöglichen die Analyse der vier Mutationsklassen (SNVs, Indels, CNVs und Fusions) im DNA‑Only‑Workflow und enthalten Reagenzien für bis zu 24 auswertbare Ergebnisse pro Sequenzierlauf auf einer Illumina NextSeq 500/550/550Dx (Research Use Only‑Modus).

Vorteile im Überblick

• Abgestimmte Gewebe‑ und Plasmaanalyse in Kombination mit dem AVENIO ctDNA Surveillance Kit V2 — identische Panelinhalte und Hybrid-Capture-Workflow zur Unterstützung von Baseline‑Erstellung und Konkordanzanalysen zwischen Gewebe und Plasma.
• Durchgängiger, schlanker Forschungsworkflow — von der Extraktion bis zur Analyse in etwa fünf Tagen; Abdeckung von SNVs, Indels, Fusions und CNVs in einem einzigen DNA‑Workflow.
• Komplette Forschungs‑Lösung — Reagenzien für DNA‑Isolation, Bibliotheksvorbereitung und Zielanreicherung zusammen mit Analytik und Reporting zur Unterstützung interner NGS‑Onkologie‑Workflows.

Analytische Leistung (Highlights)
Mutationsklassen und Mutantenallel‑Frequenz / Kopienzahl: SNVs — 5% MAF; Indels — 5% MAF; Fusions — 5% MAF; CNVs — probeabhängig.
Sensitivität und PPV (pro Variante) angegeben >99% für SNVs, Indels und Fusions bei den angegebenen Allelfrequenzen; CNV‑Spezifität in technischer Studie hoch (PPV >99%); ERBB2 und MET bei ~4,5 Kopien in Validierungsprobe detektiert.
Hinweise zu Leistungen: Die angegebenen Leistungen erfordern ≥20 Millionen Reads pro Probe für Targeted, Expanded und Surveillance Kits V2; Sensitivität bestimmt mit verifizierten Referenzproben; SNV‑Leistung panelweit; Indel‑ und Fusion‑Leistungen für Whitelist‑Varianten berichtet.

Bestimmungsgemäße Verwendung / Rechtlicher Hinweis
Nur für Forschungszwecke. Nicht für diagnostische Verfahren bestimmt.

Eigenschaften / technische Spezifikationen

• Verfügbare Panels: Targeted (17 Gene), Expanded (77 Gene), Surveillance (197 Gene)
• Workflow: Hybrid-Capture Zielanreicherung; DNA-only Workflow
• Probenart: FFPE Geweberollen/-schnitte (formalin-fixed paraffin-embedded tissue)
• Minimale DNA‑Eingabe: ≥20 ng FFPET DNA (proben‑ und kitabhängig)
• Durchsatz: Reagenzien zur Verarbeitung von bis zu 24 auswertbaren Ergebnissen pro Kit (pro Sequenzierlauf)
• Sequenzierungsplattform: Illumina NextSeq 500 / 550 / 550Dx (Research Use Only‑Modus)
• Abgedeckte Mutationsklassen: SNVs, Indels, Fusions, CNVs
• Analytische Sensitivität / PPV: >99% berichtet für SNVs/Indels/Fusions bei 5% MAF (varianten‑ und panelabhängig)
• CNV‑Detektion: meldet CNVs von ERBB2, EGFR und MET; CNV‑Leistung probeabhängig (Faktoren: Eingangs‑DNA‑Menge, Tumorgehalt, Probentyp)
• Erforderliche Lesetiefe: angegebene Leistung erfordert ≥20 Millionen Reads pro Probe
• Vorgesehene Anwendungen: Tumorprofiling, Überwachung der Tumorlast, Baseline‑Erstellung für longitudinales Monitoring, Untersuchung von Resistenzbiomarkern, Forschungsanwendungen zur minimalen Residualerkrankung (MRD)